El potencial de la selección genómica (GS) para mejorar las características de producción ha sido ampliamente demostrado en muchas especies acuícolas.
Estudio tuvo como objetivo evaluar el impacto de la disminución de la relación genómica entre las poblaciones de entrenamiento y validación en la precisión de la predicción genómica para dos rasgos clave; peso corporal y resistencia a los piojos de mar; y evaluar la interacción de la relación genética con la densidad de SNP
El potencial de la selección genómica (GS) para mejorar las características de producción ha sido ampliamente demostrado en muchas especies acuícolas.
Los programas de cría de salmón del Atlántico generalmente consisten en esquemas de prueba de hermanos, donde los rasgos que no se pueden medir en los candidatos de selección se miden en los hermanos de los candidatos. Si bien las pruebas anuales en parientes cercanos son efectivas, son costosas debido a los altos costos de genotipado y fenotipado.
«Por ello, la predicción precisa de los valores genéticos en parientes lejanos podría reducir significativamente el costo de GS», señala la investigación realizada por los investigadores Clémence Fraslin, Diego Robledo y Ross D. Houston del Roslin Institute and Royal (Dick) School of Veterinary Studies, de la Universidad de Edinburgo; y José M.Yáñez, de la Facultad de Ciencias Veterinarias y Pecuarias de la Universidad de Chile y del Center for Research and Innovation in Aquaculture (CRIA).
Así, se utilizaron datos de fenotipo y genotipo de clases de dos años de una población reproductora comercial de salmón del Atlántico.
La precisión de las predicciones genómicas fue cercana a cero cuando la predicción se realizó en todas las clases anuales, aunque esto puede reflejar una falta de correlación genética entre los mismos rasgos medidos en las diferentes clases anuales.
Dentro de una clase de un año, la reducción sistemática de la relación entre las poblaciones de entrenamiento y validación resultó en una disminución de la precisión de la predicción genómica; cuando las poblaciones de entrenamiento y validación se configuraron para que no contuvieran parientes con relaciones genómicas > 0,3, las precisiones disminuyeron en un 44 % para el recuento de piojos de mar y en un 53 % para el peso corporal.
Las poblaciones de entrenamiento y validación menos relacionadas también tendían a dar como resultado predicciones altamente sesgadas. No se encontró una interacción clara entre la disminución de la densidad de SNP y la relación entre la población de entrenamiento y validación. Estos resultados confirman la importancia de las estrechas relaciones genéticas entre las poblaciones de entrenamiento y selección en los programas de cría de salmón, y sugieren que la predicción entre generaciones utilizando los enfoques existentes comprometería gravemente la eficacia de GS.
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