{"id":48376,"date":"2023-01-17T15:34:13","date_gmt":"2023-01-17T18:34:13","guid":{"rendered":"https:\/\/www.mundoacuicola.cl\/new\/?p=48376"},"modified":"2023-01-17T15:36:35","modified_gmt":"2023-01-17T18:36:35","slug":"los-avances-en-seleccion-genomica-aplicados-a-la-salmonicultura","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.mundoacuicola.cl\/new\/los-avances-en-seleccion-genomica-aplicados-a-la-salmonicultura\/","title":{"rendered":"Los avances en selecci\u00f3n gen\u00f3mica aplicados a la salmonicultura"},"content":{"rendered":"
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Si bien el m\u00e9todo de mejoramiento gen\u00e9tico convencional (selecci\u00f3n de acuerdo a pedigree y fenotipo) ha demostrado ser efectivo en t\u00e9rminos de peso de cosecha, existen otras variables que influyen en la rentabilidad y que no pueden ser medidas directamente en los reproductores: resistencia a pat\u00f3genos, color de carne, contenido y composici\u00f3n de grasa, entre otros.<\/p>\n

Lo anterior fue el punto de inflexi\u00f3n para la incorporaci\u00f3n de la informaci\u00f3n gen\u00f3mica en los procesos de mejoramiento gen\u00e9tico, desarroll\u00e1ndose investigaciones desde la academia y en colaboraci\u00f3n con privados y entidades internacionales.<\/p>\n

A nivel local, entre las diferentes casas de estudio, la Universidad de Chile ha sido una de las m\u00e1s destacadas en el tema, a trav\u00e9s del trabajo realizado por su Facultad de Ciencias Veterinarias y Pecuarias (FAVET).<\/p>\n

Desde los a\u00f1os 90, dicha facultad comenz\u00f3 a interesarse por el mejoramiento gen\u00e9tico de los salmones, enfoc\u00e1ndose -especialmente en la \u00faltima d\u00e9cada- en el campo de la gen\u00f3mica y gen\u00e9tica molecular.<\/p>\n

EPIC4<\/strong><\/span><\/p>\n

Cr\u00e9ditos: David Tapia.<\/p>\n

\"\"Hace 5 a\u00f1os la Universidad de Chile se integr\u00f3 como entidad asociada al proyecto EPIC4, organizado por diferentes instituciones de Canad\u00e1 y que tiene por objetivo aplicar la ciencia gen\u00f3mica para la conservaci\u00f3n del Salm\u00f3n Coho en la provincia de Columbia Brit\u00e1nica.<\/p>\n

\u201cEn Canad\u00e1 el salm\u00f3n Coho es muy importante como especie silvestre, por lo tanto se apuntaba a implementar y generar conocimiento en relaci\u00f3n al genoma. Sin embargo, si vemos a nivel de acuicultura, ellos no producen mucho salm\u00f3n Coho, por lo que Chile era un socio estrat\u00e9gico importante si quer\u00edan aplicarla dentro del programa\u201d, se\u00f1ala el Dr. Jos\u00e9 Manuel Y\u00e1\u00f1ez, Director<\/p>\n

de Investigaci\u00f3n y Desarrollo de la Facultad de Ciencias Veterinarias y Pecuarias de la Universidad de Chile, quien adem\u00e1s particip\u00f3 como investigador principal en el \u00e1rea Acuicultura del proyecto canadiense.<\/p>\n

As\u00ed fue como el acad\u00e9mico, en conjunto con estudiantes de la Facultad y empresas como Aquainnovo y AquaChile, participaron en la generaci\u00f3n de 5 publicaciones cient\u00edficas en el marco del EPIC4, todas ellas utilizando poblaciones chilenas de cultivo de salm\u00f3n Coho.<\/p>\n

\u201cEvaluamos caracter\u00edsticas productivas interesantes, entre ellas la tasa de crecimiento, la resistencia a SRS y otras caracter\u00edsticas como rendimiento de filete y variabilidad gen\u00e9tica de poblaciones chilenas incorporando informaci\u00f3n del genoma. Este fue secuenciado y se liber\u00f3 una primera versi\u00f3n, la que utilizamos para poder mejorar los procesos de selecci\u00f3n gen\u00e9tica aqu\u00ed en Chile\u201d, explic\u00f3.<\/p>\n

\u201cPara nosotros como Universidad de Chile fue s\u00faper importante, porque no solo nos permiti\u00f3 generar productos de inter\u00e9s cient\u00edfico, sino tambi\u00e9n contribuy\u00f3 a la formaci\u00f3n de estudiantes de pregrado de Medicina Veterinaria, Magister, Doctorado y Posdoctorado\u201d, recalca Y\u00e1\u00f1ez.<\/p>\n

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Cr\u00e9ditos: Jos\u00e9 Manuel Y\u00e1\u00f1ez.<\/p>\n

Espacios de divulgaci\u00f3n<\/strong><\/span><\/p>\n

\u00a0<\/strong>Entre fines del 2020 y los primeros meses de 2021, Dr. Y\u00e1\u00f1ez ha participado en al menos 4 webinars exponiendo la aplicaci\u00f3n de la gen\u00f3mica en la acuicultura, marcando presencia durante febrero en el X Foro Iberoamericano de los Recursos Marinos y la Acuicultura.<\/p>\n

\u201cSi tenemos una baja precisi\u00f3n de los valores gen\u00e9ticos, como ocurre con el m\u00e9todo convencional en la que se ocupan grupos familiares, tendremos una disminuci\u00f3n de la intensidad de selecci\u00f3n, adem\u00e1s de una consanguinidad que nos lleva a resultados limitados. Por eso propusimos combinar la informaci\u00f3n de pedigree, fenotipos, marcadores moleculares de tipo SNPs y modelos que incorporen estos \u00faltimos para incrementar la precisi\u00f3n de los valores gen\u00e9ticos, la respuesta a la selecci\u00f3n y acelerar el progreso gen\u00e9tico\u201d, explic\u00f3 Y\u00e1\u00f1ez durante su exposici\u00f3n.<\/p>\n

De acuerdo al acad\u00e9mico, para llegar dicha propuesta se utilizan marcadores moleculares de tipo Polimorfismos de Nucle\u00f3tidos Simples (con cambios en un solo nucle\u00f3tido). A trav\u00e9s de los cuales fue posible caracterizar variantes, secuenciar, genotipar y trazar.<\/p>\n

\u201cActualmente existen herramientas gen\u00f3micas que incorporan miles de SNPs en trucha Arcoiris, salm\u00f3n Atl\u00e1ntico y salm\u00f3n Coho, con varios paneles de marcadores liberados\u201d, detall\u00f3 el investigador.<\/p>\n

Posteriormente, explic\u00f3 a trav\u00e9s de un gr\u00e1fico que la selecci\u00f3n gen\u00f3mica es m\u00e1s precisa que el m\u00e9todo convencional basado en pedigree.<\/p>\n

\"\"\u201cPor ejemplo, si tenemos diferentes familias de peces en funci\u00f3n de cargas parasitarias, gui\u00e1ndonos por el pedigree seleccionaremos aquel grupo que tiene el promedio m\u00e1s bajo. Sin embargo, hasta en las mejores familias existen individuos cuyo conteo puede ser muy superior. Adem\u00e1s, al seleccionar un grupo familiar la consanguinidad puede traer otros problemas a futuro. En cambio, si utilizamos gen\u00f3mica, de cada familia podremos extraer el mejor animal de una manera precisa, y al mismo tiempo tendremos una mayor representaci\u00f3n de las familias, lo que nos llega a evitar un incremento de la consanguinidad\u201d, ejemplific\u00f3.<\/p>\n

\u201cEsto lo hemos probado en la pr\u00e1ctica con estudios de resistencia a Piscirickettsia Salmonis en trucha Arcoiris, salm\u00f3n Coho y Atl\u00e1ntico, viendo que la selecci\u00f3n convencional siempre presenta menor precisi\u00f3n (m\u00e1s lenta) al momento de seleccionar en comparaci\u00f3n a la incorporaci\u00f3n de gen\u00f3mica\u201d, agreg\u00f3.<\/p>\n

\u00a0<\/strong>Aplicaciones en la industria <\/strong><\/span><\/p>\n

\u201cEs importante se\u00f1alar que toda esta informaci\u00f3n no es solo ciencia b\u00e1sica, sino que es aplicada, y ha tenido mejoras de procesos en algunas empresas salmonicultoras que actualmente est\u00e1n trabajando junto a la Universidad de Chile\u201d, se\u00f1al\u00f3 Y\u00e1\u00f1ez.<\/p>\n

En ese sentido, compa\u00f1\u00edas como AquaChile y Camanchaca destacan en sus \u00faltimos reportes de sustentabilidad la aplicaci\u00f3n de la gen\u00f3mica con foco en el \u00e1mbito sanitario<\/p>\n