Una veintena de estudiantes de postgrado e investigadores j\u00f3venes se congregaron el lunes 26 de enero en el Centro de Biotecnolog\u00eda de la Universidad de Concepci\u00f3n para participar de EpiAqua, curso organizado por el Centro INCAR\u00b2 y COPAS Coastal.<\/p>\n
La iniciativa que explora los \u00faltimos avances de la epigen\u00f3mica aplicada a la acuicultura comenz\u00f3 con el saludo del Subdirector de COPAS Coastal, Dr. Fabi\u00e1n Tapia, y del Director de INCAR\u00b2, Dr. Cristian Gallardo-Esc\u00e1rate, para luego dar paso a la charla magistral \u00abShellfish Environmental Memory Beyond Epigenetics\u00bb, del Acad\u00e9mico de la Universidad de Washington, Dr. Steven Roberts.<\/p>\n
En su presentaci\u00f3n el Dr. Roberts hizo referencia a la iniciativa que encabeza y busca la restauraci\u00f3n de ostras nativas en Estados Unidos. \u201cLa Epigen\u00e9tica es una herramienta vital para entender c\u00f3mo se adaptan los organismos acu\u00e1ticos, especialmente en escenarios de cambio clim\u00e1tico, contribuyendo as\u00ed a la restauraci\u00f3n de diferentes organismos\u201d, explic\u00f3.<\/p>\n
Posteriormente, la Dra. Yeny Leal, gui\u00f3 el Genomic Boot Camp, \u00abHerramientas de Visualizaci\u00f3n NGS\u00bb. El trabajo se realiz\u00f3 utilizando Idep (Integrated Differential Expression and Pathway Analysis), un servidor web que integra control de calidad, an\u00e1lisis estad\u00edstico, visualizaci\u00f3n avanzada y an\u00e1lisis funcional dentro de un mismo entorno. Adicionalmente se emple\u00f3 ShinyGO, una plataforma web interactiva especializada en an\u00e1lisis de enriquecimiento funcional, que permite explorar ontolog\u00edas GO, rutas KEGG y redes funcionales a partir de listas de genes. \u201cEl uso complementario de Idep y ShinyGO permite comparar estrategias de an\u00e1lisis funcional y reforzar la interpretaci\u00f3n biol\u00f3gica de los resultados transcript\u00f3micos\u201d, expreso la Dra. Leal.<\/p>\n
La jornada de la tarde en EpiAqua comenz\u00f3 con la presentaci\u00f3n \u00abSea Lice Epigenomics\u00bb, del Director del Centro INCAR\u00b2, Dr. Cristian Gallardo-Esc\u00e1rate, en la que destac\u00f3 la importancia de la herramienta epigen\u00f3mica en la acuicultura en el combate contra el Caligus.<\/p>\n
\u201cLa epigen\u00f3mica est\u00e1 cada vez ganando m\u00e1s importancia y actualmente hay tecnolog\u00edas que permiten estudiar y entender c\u00f3mo se adaptan los recursos gen\u00e9ticos. Actualmente estamos tratando de entender los mecanismos que son importantes para la determinaci\u00f3n sexual en Caligus, un \u00e1rea que queremos desarrollar desde INCAR como una alternativa de control a trav\u00e9s de la edici\u00f3n g\u00e9nica experimental\u00bb, a\u00f1adi\u00f3 el Director de INCAR\u00b2, Dr. Cristian Gallardo-Esc\u00e1rate.<\/p>\n
Finalmente, EpiAqua cerr\u00f3 su primera jornada con un Camp Boot sobre Secuenciaci\u00f3n de Nanopore, actividad pr\u00e1ctica realizada en el Laboratorio de Biotecnolog\u00eda y Gen\u00f3mica Acu\u00edcola (LBGA) de INCAR, y dirigida por la Investigadora Principal de INCAR\u00b2, Dra. Valentina Valenzuela-Mu\u00f1oz. En ella, los estudiantes se familiarizaron con el equipo y aprendieron a preparar y cargar el equipo para hacer la secuenciaci\u00f3n. \u201cA trav\u00e9s del trabajo pr\u00e1ctico en el laboratorio, mostramos las diferencias entre las dos plataformas que nosotros tenemos, MinION y PromethION, para que puedan conocer las caracter\u00edsticas de cada equipo, su rendimiento y las librer\u00edas que se pueden utilizar en cada uno\u201d, finaliz\u00f3 la Dra. Valenzuela.<\/p>\n
EpiAQUA se realiza entre el 26 y 27 de enero en el Centro de Biotecnolog\u00eda de la Universidad de Concepci\u00f3n y est\u00e1 organizado por el Centro COPAS Coastal y el Centro de Investigaci\u00f3n Aplicada, INCAR\u00b2, financiado por ANID.<\/p>\n
<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"
EpiAqua reuni\u00f3 a estudiantes e investigadores para abordar avances en epigen\u00f3mica aplicada a la acuicultura.<\/p>\n","protected":false},"author":8,"featured_media":84825,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"footnotes":""},"categories":[66],"tags":[143,7060,19004,475,13198,28703,16044,2567,28051,22282,1342],"class_list":["post-84822","post","type-post","status-publish","format-standard","has-post-thumbnail","hentry","category-acuicultura","tag-acuicultura","tag-anid","tag-biotecnologia-acuicola","tag-caligus","tag-copas-coastal","tag-epiaqua","tag-epigenomica","tag-genomica","tag-incar","tag-postgrado","tag-universidad-de-concepcion"],"yoast_head":"\n