Se trata del estudio "Respuesta transcriptómica diferencial de la trucha arcoíris a la infección por dos cepas de IPNv".
El estudio «Respuesta transcriptómica diferencial de la trucha arcoíris a la infección por dos cepas de IPNv» fue articulado por el Aquaculture Genomics Lab junto al Center for Research and Innovation in Aquaculture (CRIA) de la Universidad de Chile.
El Aquaculture Genomics Lab, liderado por el Dr. José Manuel Yañez, junto al Dr. David Tapia, ambos miembros del CRIA de la Universidad de Chile acaban de publicar el artículo «Differential Transcriptomic Response of Rainbow Trout to Infection with Two Strains of IPNV2», investigación en la cual se evaluó el perfil transcripcional de trucha arcoíris frente a la infección con dos genogrupos de IPNV (1 y 5).
El virus IPN (IPNV) causa la enfermedad altamente contagiosa que afecta a los salmónidos cultivados. Los aislamientos de IPNV se han clasificado filogenéticamente en siete genogrupos, de los cuales dos están presentes en Chile, los genogrupos 1 y 5.
«Este estudio tuvo como objetivo comparar la respuesta transcriptómica de alevines de trucha arco iris desafiados con dos aislamientos chilenos de IPNV, RTTX (genogrupo 1) y ALKA (genogrupo 5). Se tomaron muestras de tejido de individuos desafiados y controles 1, 7 y 20 días después de la exposición y se analizaron mediante RNA-Seq.
Los resultados revelaron que la infección con RTTX provocó una mayor modulación del transcriptoma de la trucha en comparación con la infección con ALKA, generando un mayor número de genes altamente expresados diferencialmente en relación con el pez control.
El enriquecimiento de Gene Ontology indicó que las funciones relacionadas con las respuestas inflamatoria e inmunológica se modularon en peces desafiados con ambos aislamientos a lo largo del ensayo, pero con diferentes patrones de regulación.
En el día 1 después de la exposición, estas funciones se activaron en los desafiados con ALKA, pero se suprimieron en los peces desafiados con RTTX. Estos resultados sugieren que la trucha arco iris exhibe una respuesta transcriptómica diferencial a la infección con los dos aislados de IPNV genéticamente distintos, especialmente en los primeros momentos posteriores a la infección.
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